Infection de la pénétration et de la réinfection de l’infection par le SRAS-CoV-2 pendant l’onde omicron

En utilisant des données épidémiologiques détaillées de la surveillance du SRAS-CoV-2 au sein du système pénitentiaire de l’État de Californie, nous avons constaté que la vaccination et l’infection antérieure réduisaient l’incidence de l’infection par le SRAS-CoV-2 pendant l’Omicron (sous-variantes BA.1 et BA.2) période. La vaccination et l’infection précédente ont été associées à des diminutions similaires de l’infection pendant l’infection par le SRAS-CoV-2, et en particulier, des doses supplémentaires de vaccination (par exemple, des doses de rappel) contre le SRAS-CoV-2 et une vaccination plus récente ont entraîné une diminution plus importante de l’infection . Il convient de noter que les réductions des risques de transmission associés à la vaccination et à une infection antérieure étaient additives, ce qui indique le bénéfice accru conféré par la vaccination pour réduire l’infection des cas même après une infection antérieure. Indépendamment de la vaccination et/ou de l’infection naturelle antérieure, l’infection et la réinfection soudaines par le SRAS-CoV-2 sont restées hautement contagieuses et ont représenté 80 % des transmissions observées dans la population étudiée, qui présentait des niveaux élevés d’infection et de vaccination antérieures. Cette observation confirme que la vaccination et l’immunité traditionnelle naturelle à elles seules n’élimineront pas le risque d’infection par le SRAS-CoV-2, en particulier dans les milieux à haut risque, comme les prisons.

Des études antérieures au cours de la vague de variante delta et avant la vaccination de rappel ont été largement mitigées sur la question de savoir si l’infection pénétrante du SRAS-CoV-2 chez les personnes vaccinées est moins contagieuse.6Et7Et8 ou tout aussi contagieux9Etdix à la primo-infection. Dans des études plus récentes sur les contacts à domicile pendant l’ère de la variante Omicron11Et1 2Et13La vaccination a souvent réduit l’infection par le SRAS-CoV-2. Plusieurs facteurs peuvent avoir amélioré notre capacité à observer des résultats statistiquement significatifs dans l’étude actuelle. Le risque de transmission entre contacts étroits en milieu carcéral et la cohérence de la structure des contacts, en particulier à la lumière de la transmissibilité accrue de la variante Omicron SARS-CoV-2, peuvent avoir amélioré la puissance statistique de notre échantillon. Dans le même ordre d’idées, une proportion plus élevée de cas indicateurs de notre échantillon ont déjà été vaccinés ou infectés, ce qui améliore la possibilité de comparer le risque de transmission entre les cas indicateurs vaccinés ou non vaccinés et ceux qui ont été précédemment infectés ou non.

La principale découverte est que la réduction induite par le vaccin de l’infection pénétrante par le SRAS-CoV-2 semble être dose-dépendante. Chaque dose du vaccin a fourni une réduction relative supplémentaire de 11 % de l’infection, qui était principalement due à la population recevant la dose de rappel. Les résultats de cette étude soutiennent les effets indirects de la vaccination contre le COVID-19 (en particulier les doses de rappel) pour ralentir la transmission du SRAS-CoV-2 et s’appuient sur des preuves d’effets directs de la vaccination contre le COVID-19.23 Souligner l’importance générale de la vaccination contre le COVID-19. Les implications de ces résultats sur la santé publique appuient davantage la politique actuelle utilisant des doses de rappel de vaccination24 Atteindre l’objectif de réduction de la transmission au niveau de la population. L’effet des doses supplémentaires de vaccin bivalent, désormais autorisées pour les personnes de plus de 5-6 ans25, lorsque l’envoi doit être une priorité pour un complément d’étude. Des considérations supplémentaires concernant le moment des doses de vaccin sont également nécessaires, car nous avons constaté que les cas standard ayant des antécédents éloignés d’un vaccin COVID-19 étaient plus à risque de transmission à des contacts étroits. Compte tenu de cette découverte, cette étude soulève la possibilité d’une vaccination de masse en temps opportun en milieu carcéral pendant les vagues de tempête pour ralentir la transmission.

Les découvertes de cette étude ont des implications directes pour aborder l’inégalité COVID-19 dans la population carcérale par la vaccination supplémentaire. Dans les prisons californiennes au moment de cette étude, bien que 81 % des résidents et 73 % du personnel aient terminé la série de vaccination initiale, seuls 59 % des résidents et 41 % du personnel avaient reçu le nombre de doses de vaccination recommandées par les Centers for Disease Contrôle et prévention Selon l’âge et les conditions médicales26. Nos résultats fournissent également une base pour des considérations supplémentaires sur le logement des cas en fonction de la vaccination antérieure et des antécédents d’infection dans les augmentations futures et peuvent être utilisés en combinaison avec d’autres mesures, telles que la réduction de la population et les interventions de ventilation, pour protéger la population carcérale.

Cependant, cette étude souligne également la vulnérabilité continue au COVID-19 parmi les résidents et le personnel des établissements correctionnels malgré la vaccination généralisée, l’immunité naturelle et l’utilisation d’interventions non pharmaceutiques. Le taux d’attaque global du SRAS-CoV-2 dans la population d’étude (qui étaient généralement transférées en isolement après l’apparition des symptômes ou un test positif) était de 30 %, et les cas indicateurs d’infection ou de réinfection sont restés très contagieux, remettant en question la capacité des taux de vaccination élevés à eux seuls à prévenir toute transmission du SRAS-CoV-2 en milieu correctionnel. Aux États-Unis, qui incarcèrent plus de personnes par habitant que tout autre pays au monde26 Il compte un quart de la population carcérale mondiale, les établissements correctionnels se caractérisent par des installations mal ventilées, une population avec des taux croissants de problèmes de santé pathologiques et des logements d’immigrants surpeuplés et dangereux.18Et27Et28Et29. Étant donné l’incapacité des efforts actuels à réduire la transmission du SRAS-CoV-2, les efforts de démantèlement pourraient avoir des impacts significatifs sur la réduction des cas.

Le taux d’attaque secondaire dans cette étude était à l’extrémité inférieure des estimations publiées par rapport aux études à domicile. Il convient de noter que le taux d’attaque secondaire de la variante Omicron SARS-CoV-2 dans les études récentes sur les ménages varie de 29% à 53%.11Et1 2Et13, contrairement au taux d’attaque de 30 % dans cette étude. Le milieu carcéral présente des différences épidémiologiques distinctes pour les familles. Un milieu de vie dense augmente la probabilité de transmission en milieu carcéral par rapport à un ménage, tandis que des tests asymptomatiques fréquents (avec isolement des cas positifs) dans les prisons sont plus susceptibles d’entraîner une réduction du temps d’exposition et du risque de transmission ultérieur par rapport aux ménages. Une transition de cellule de prison est également susceptible d’être plus régulière qu’une famille.

Les points forts de cette étude comprennent l’accès à des dossiers détaillés pour tous les résidents du système pénitentiaire de l’État de Californie, y compris la réception précédente du vaccin COVID-19 des individus et l’historique d’infection naturelle antérieur (basé sur des tests répétés tout au long de la pandémie), ainsi qu’un social spécifique registre du réseau des dortoirs des résidents toutes les nuits pendant la période d’étude. Nous utilisons une définition cohérente du contact social entre le cas indicateur de COVID-19 et le contact étroit basée sur la normalisation du type de cellule. Des tests fréquents garantissent une identification précoce de l’infection et une capture systématique des infections asymptomatiques ou asymptomatiques afin d’éviter les biais dus au statut immunitaire des participants (ce qui pourrait affecter l’apparition temporelle des symptômes). Le risque d’erreur de classification des contacts étroits est faible puisque la plupart des tests de suivi chez les contacts étroits ont eu lieu après la première exposition à une condition indicatrice (Remarques supplémentaires). La grande taille de l’échantillon facilite les analyses de la contribution des groupes de vaccination précédents et de l’infection naturelle au risque de transmission, y compris les analyses examinant l’effet des doses de rappel.

Les limites doivent également être prises en compte. Nous ne pouvons pas exclure la possibilité qu’une certaine confusion résiduelle (par exemple, des différences de comportement affectant le risque de transmission) se soit produite entre les personnes vaccinées contre le SRAS-CoV-2 et celles qui ne l’étaient pas. Il est possible que les personnes testées positives pour le SRAS-CoV-2 n’aient pas été infectées par le cas index qui leur a été attribué, mais plutôt par des interactions avec des personnes infectées en dehors de leur cellule. Cependant, on s’attendrait à ce que cette mauvaise distribution supprime les associations claires du risque de transmission avec le statut vaccinal dans les cas indicateurs et les antécédents d’infection, mais ne biaise pas les estimations relatives. Pour mieux répondre au risque de mauvaise attribution, nous avons ajusté les antécédents pour l’incidence du SRAS-CoV-2 et apparié les paires de contacts par établissement et heure. Notre population d’étude est un sous-ensemble de la population carcérale totale en Californie et peut ne pas être représentative de tous les lieux de détention. Les études sur l’infection par le SRAS-CoV-2 peuvent être sujettes à des biais30Et31Et32. Les critères stricts d’inclusion et d’exclusion dans cette étude peuvent biaiser l’analyse, bien que nous ayons effectué des analyses de sensibilité sur ces critères avec des résultats généralement cohérents. Nous avons également ajusté les infections antérieures dans les analyses pour tenir compte des préoccupations potentielles concernant la sensibilité différentielle à une infection antérieure chez les personnes vaccinées par rapport aux personnes non vaccinées. Compte tenu de la capacité limitée de test du SRAS-CoV-2 au début de l’épidémie et de la décision de certaines populations de refuser le test, il est possible que l’infection dans certaines populations n’ait pas été détectée, bien que cette erreur de classification devrait biaiser nos résultats à zéro. Le dépistage du SRAS-CoV-2 a été variable au fil du temps dans le système pénitentiaire, avec des périodes de dépistage hebdomadaire de routine et d’autres périodes de dépistage interactif ; Cependant, les périodes sans test interactif correspondent à des moments où il était peu probable que le SRAS-CoV-2 circule à des niveaux élevés dans les établissements, ce qui indique qu’il est peu probable que cela biaise significativement les résultats. Les résultats de l’étude sur les rappels peuvent également être liés aux effets d’une vaccination récente. Cette conception de l’étude n’a pas fourni de base pour déterminer les effets de la vaccination et de l’infection antérieure sur le risque de contracter le SRAS-CoV-2 chez les contacts étroits, bien que nous ayons ajusté l’infection et la vaccination antérieures chez les contacts étroits dans l’analyse primaire. Il convient de noter que l’efficacité du vaccin contre l’infection chez les détenus au sein de cette population a été rapportée au cours de périodes antérieures33Et34. Nous n’avons pas d’historique détaillé du masquage au niveau de la personne, des symptômes ou des seuils de cycle pour la PCR ou les tests sérologiques. Au cours de l’étude, les sous-variantes prédominantes d’Omicron dans les prisons de Californie et de Californie étaient BA.1 et BA.2 basées sur l’observation génétique, bien que nous n’ayons pas génotypé chaque isolat de SARS-CoV-2 dans cette étude.

Cette étude montre que la surinfection du COVID-19 par le variant Omicron reste hautement contagieuse, mais que la vaccination comme l’infection naturelle réduisent la transmission, avec le bénéfice de doses vaccinales supplémentaires. Alors que l’infection et la surinfection par le SRAS-CoV-2 deviennent la condition dominante du COVID-19, cette étude soutient l’importance des doses de rappel pour réduire la transmission au niveau de la population compte tenu de la vaccination de masse en temps opportun pendant les augmentations, avec une importance particulière dans le cas d’une vulnérabilité élevée. La densité combine les paramètres.

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